Günther Faimann wurde in Niederösterreich, im Waldviertel, geboren. Aufgewachsen in einer musikalischen Familie begann er bereits in jungen Jahren mit dem Flötenspiel und setzte dies an der Universität für Musik und darstellende Kunst mit Robert Wolf und Raphael Leone fort. Sein Aufbaustudium brachte ihn zum Konservatorium der Musik von Giuseppe Tartini nach Triest/Italien. Dort konnte er seine Meisterklasse mit Luisa Sello abschließen.
Seit 2011 bringt er seine Expertise als Archivar und Bibliothekar des Musikvereins Wien, Gesellschaft der Musikfreunde, ein. Das Archiv, die Bibliothek und diverse Kollektionen stellen eine der fünftgrößten und wichtigsten Musiksammlungen der Welt dar.
Als Mitglied vieler klassischer Musikensembles ist er gerade mit dem Ensemble Simorgh auf einer Reise in die Werke traditioneller persischer Musik und Texte.
Er lebt in Wien und spielt auch den Doppelbass beim Wiener Akademiker Philharmonikerorchester.